Η Μονή Αρκαδίου βρίσκεται κοντά στο χωριό Αμνάτος, 23 χιλιόμετρα ανατολικά του Ρεθύμνου, στα σύνορα των επαρχιών Μυλοποτάμου, Ρεθύμνου και Αμαρίου. Χτισμένη σε υψόμετρο 500 μέτρων, δεσπόζει σε ένα εύφορο οροπέδιο με ελαιώνες, αμπέλια, πεύκα, κυπαρίσσια και δαμάσκηνα, προσφέροντας ένα μαγευτικό φυσικό περιβάλλον.

Γύρω από το μοναστήρι υπάρχουν πολλά γραφικά εκκλησάκια που ενισχύουν τη θρησκευτική και ιστορική σημασία του χώρου. Δίπλα στη Μονή ξεκινά το πανέμορφο Αρκαδιώτικο φαράγγι, προσφέροντας στους επισκέπτες την ευκαιρία για πεζοπορία μέσα σε ένα εντυπωσιακό φυσικό τοπίο και μια μοναδική εμπειρία σύνδεσης με την ιστορία και τη φύση της Κρήτης.